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Center for Cell-based Therapy

Center for Cell-based Therapy

Curso de verão em Bioinformática chega a 12ª edição

O Centro de Terapia Celular da USP promoveu o “XII Curso de Verão em Bioinformática”. As palestras foram realizadas no Hemocentro de Ribeirão Preto, de 28/01 a 08/02.
 
A proposta desta edição foi explorar a integração de ferramentas in silico para predizer as funções regulatórias e não-regulatórias dos RNAs longos não codificantes (lncRNAs), uma classe com mais de 200 nucleotídeos que não codificam proteínas.
 
Estudos recentes demonstraram que essas moléculas executam papéis importantes na biologia do câncer, e seus níveis de expressão podem estar associados à metástase, prognóstico e recorrência da doença.
 
Os lncRNAs podem exercer relações regulatórias e não-regulatórias que abrangem uma diversidade de mecanismos funcionais envolvidos em processos epigenéticos, transcricionais ou pós-transcricionais complexos, muitos dos quais empregam capacidade dos lncRNAs de se ligarem de uma maneira específica à sequências de DNA, RNA ou proteína.
 
Os dados de RNA-Seq podem ser utilizados na compreensão dos processos biológicos e essa informação de expressão global fornece um recurso rico para identificar potenciais relações regulatórias ao nível de RNA.
 
O curso foi dividido em duas partes, uma Teórica Introdutória, com o objetivo de apresentar um problema biológico e as abordagens de Bioinformática que podem ser utilizadas para estudá-lo, e outra Prática, dedicada a investigação através de pesquisas computacionais e experimentais.
 
Os estudantes selecionados tiveram contato com um cenário real de elaboração e execução de um projeto na área, promovendo uma discussão multidisciplinar para resolução dos desafios apresentados.
 
Confira a programação no site http://lgmb.fmrp.usp.br/cvbioinfo/.
 
    
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Palestra: “Sequenciamento de Nova Geração na Prática Clínica”

A pesquisadora Fernanda Gutierrez Rodrigues, do Hematology Branch, National Institutes of Health (NIH-EUA), ministrou a palestra “Sequenciamento de Nova Geração na Prática Clínica”, no dia 25 de janeiro, no Auditório do CEAPS/Hospital das Clínicas da FMRP-USP.

A palestrante é graduada em Farmácia e Bioquímica pela Universidade Federal do Espírito Santo. Atualmente é aluna de Doutorado na FMRP-USP e atua no estudo dos telômeros, telomerase e telomeropatias. Também apresenta experiência na área de Bioquímica, com ênfase em química de proteínas.

O evento teve o apoio do Centro de Terapia Celular (CTC-USP) e do Hemocentro RP. 

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Estudo destaca relação entre câncer de pênis e mutações no genoma das mitocôndrias

Peter Moon | Agência FAPESP – Um estudo publicado por pesquisadores brasileiros na revista Molecular Biology Reports sugere a existência de mutações no genoma mitocondrial que podem favorecer a progressão do tumor peniano.

O câncer de pênis é um tumor raro nos países desenvolvidos, representando cerca de 0,4% das neoplasias malignas em homens, na Europa e nos Estados Unidos. No Brasil a incidência é bem maior. Segundo o Instituto Nacional do Câncer (Inca), esse tipo de tumor corresponde a 2% de todos os casos de câncer que atingem o homem.

“É a primeira vez que se estuda o genoma mitocondrial para verificar alterações que possam estar relacionadas ao tumor peniano”, disse Wilson Araújo da Silva Junior, professor na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (FMRP-USP) e um dos autores principais do trabalho, que foi conduzido no âmbito do Centro de Terapia Celular (CTC), um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs) financiados pela FAPESP.

O tipo mais frequente do câncer de pênis é o carcinoma epidermoide, também denominado espinocelular ou escamoso, que representa 95% dos tumores malignos do pênis. Apesar de o câncer peniano ser uma doença com alto potencial de cura se identificada em estágios mais precoces, a demora no diagnóstico e na procura por tratamento específico é observada em mais de 50% dos casos.

O câncer peniano apresenta maior incidência em homens que vivem em regiões rurais e com idades a partir dos 50 anos, embora possa atingir os mais jovens. Está relacionado a baixas condições socioeconômicas e de instrução. A doença é causada principalmente pela falta de higiene íntima e tem forte prevalência em homens com fimose.

Clique aqui para conferir a reportagem completa.

Prof. Wilson Araújo da Silva Junior

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Mestrado em Bioinformática no Hemocentro RP com bolsa FAPESP

O Laboratório de Biologia Molecular do Hemocentro de Ribeirão Preto (FMRP-USP) oferece uma vaga de mestrado em bioinformática, com bolsa FAPESP, no projeto “Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas”.

O bolsista selecionado será responsável pela otimização e implementação de subprojetos para análise do metagenoma viral (filtragem de sequências, alinhamentos e designação taxonômica e montagem de genomas de novo) obtido a partir de plasma de vários grupos de pacientes e hemocomponentes.

O aluno receberá treinamento de pesquisadores do Instituto Pasteur, da França, e será orientado por Svetoslav Nanev Slavov, pesquisador responsável pelo projeto.

Os candidatos devem ter conhecimento básico de Linux; linguagens de programação Perl, Python e/ou R; banco de dados; e análise de dados de sequenciamento de nova geração.

Os interessados devem enviar currículo, até o dia 28 de fevereiro, para o e-mail svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br.

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